根据器官移植供受双方的遗传关系，可分为自体移植、同系移植、同种异体移植和异种移植：
自体移植
供者与受者系同一个体，故对移植物不发生免疫排斥，如肾动脉狭窄患者切除狭窄段动脉后实施的自体肾移植，肝外伤或肿瘤患者切除肝脏经体外处理后移植回腹腔的自体肝移植。
同系移植
移植物取自遗传基因与受者完全相同的或基本相似的供者，如同卵双生间移植或近交系动物间移植，一般都可成功。这类移植在临床非常少见[3]。
同种异体移植
供者和受者同种但非同一个体，遗传基因有差异，常伴排斥反应。临床器官移植多属此类，移植术后需要长期应用免疫抑制药物预防排斥反应。
异种移植
不同种之间的移植，排斥率极高，目前尚无长期存活的报道。由于预后不良，并且涉及伦理等问题，目前绝大多数国家禁止临床开展此类移植。
根据供体存活状态不同，器官移植供体类型可分为活体供体、脑死亡供体和无心跳供体。目前，在欧洲和美国，以脑死亡供体和无心跳供体为主；在日本、韩国、香港和台湾等地区，受文化习俗影响，脑死亡供体和无心跳供体相对较少，活体器官移植比较发达；在我国大陆地区，早期移植物多来自无心跳供体，少数来源于活体供体，近年来国家大力提倡公民逝世后捐献器官，心脏死亡捐献器官移植工作获得了长足进步，全国已完成心脏死亡捐献器官移植近千例，有效缓解了器官短缺问题。
活体供体
活体器官移植的供者为健康人，捐献的器官类型以肾脏最多，其次为部分肝脏，小肠和胰腺则更为罕见。为了保障供者的利益，活体移植前必须进行更为严格的评估，确保供者充分的知情同意，排除供者受经济驱使和外来胁迫等因素。在我国，严格限定供受者必须为直系亲属或三代以内的旁系亲属。由于活体捐献的热缺血时间短，移植效果显著优于脑死亡和无心跳供者来源的器官移植。
脑死亡供体
脑死亡是指全脑功能不可逆的完全丧失，是比心脏更为科学的死亡定义。目前世界范围内已有将近90个国家接受脑死亡标准用于判定临床死亡。在脑死亡后，部分患者尚可存在心跳，此时根据死者生前的意愿和/或争得家属同意可以实施器官获取，用于临床移植。脑死亡供者的器官功能相对心脏死亡供者更容易维护，移植效果也更好。
无心跳供体
心脏停搏是传统的临床死亡标准。如能在心脏停搏后的短时间内正确获取和保存器官，部分器官可以成功用于移植。与脑死亡捐献相似，心脏死亡器官捐献同样需要获得死者生前意愿和家属的同意。无心跳供体器官由于存在较长时间的热缺血损伤，术后移植物功能恢复延迟的发生率显著增加。
根据移植部位不同，可分为原位移植和异位移植：
原位移植
原位移植需要在切除病变的器官后植入移植物，手术技术更为复杂。肝移植、心脏移植等都属于原位移植。
（2）异位移植
异位移植不需要切除原有的器官，只要在合适部位植入移植物即可。肾移植、胰腺移植等都属于异位移植。
根据移植物种类不同，器官移植可分为肾移植、肝脏移植、心脏移植、肺移植、胰腺移植、小肠移植以及多器官移植等：
肾移植
肾移植是最早获得临床成功的器官移植，主要用于治疗各种肾脏疾病导致的肾功能衰竭。与慢性透析相比，肾移植患者的生活质量显著提高。目前我国每年可完成5000余例肾移植手术，患者1年存活率超过90%，5年存活率接近80%。
肝移植
肝移植主要用于治疗各种类型的肝硬化、先天性胆道闭锁、肝豆状核变性等所致的肝功能失代偿和早期肝癌患者。我国每年可完成肝移植手术2000例左右，术后1、3、5年累积存活率分别为77.97%、65.38%、60.53%，存活时间最长者已达16年。
心脏移植
心脏移植主要用于各种原因导致的新功能不全患者。与肝、肾相比，心脏耐受热缺血损伤和冷缺血损伤的能力更差，围手术期治疗要求更高。目前我国开展心脏移植的医院相对较少，但移植效果已接近国际先进水平。
肺移植
肺移植主要用于治疗各种呼吸功能衰竭患者。由于肺移植术后并发症发生率高，国内开展的单位较少，移植数量远低于肾、肝、心脏移植。
胰腺移植
胰腺移植主要用于治疗糖尿病。由于胰腺移植术后并发症发生率较高，远期效果不理想，目前多开展胰肾联合移植，已很少单独实施胰腺移植。
小肠移植
小肠移植主要用于治疗各种原因导致的小肠切除术后剩余小肠功能不能满足人体需要的患者。由于肠道存在大量的淋巴组织，小肠移植术后容易发生排斥反应，影响远期预后。国内开展小肠移植的单位非常有限。
联合器官移植
肝肾联合移植、胰肾联合移植、心肺移植、腹部器官簇移植等多器官联合移植已广泛应用于临床。
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